Судя по размеру файлов в архиве только Flash, без eeprom

У этих процов две области User Flash и Data Flash, их нужно вычитывать все, одно без другого не имеет смысла. Вы вычитали вообще непонятно что, похоже там всё в куче, адресация байтов нарушена, пустые области FF вырезаны. Где заканчиваете одно и начинается другое, непонятно. Если ваш софт не позволяет сохранять структуру в *.bin, попробуйте сохранять дамп в формате .s19. Если в вашем софте можно указывать конкретный диапазон адресов, вычитывайте в два отдельных файла User и Data.

Судя по адресации похоже на чтение Оранжем только области Flash

Ни то и ни другое. И user и data присутствуют, но при сохранении убрал галочку absolute image и FDT сжал файл на свое усмотрение. Не подумал я о том что, не все с этим софтом работают, уж извините. Так что корректно записать получится скорее только черезт FDT. s19 добавлю по возможности.

И как эти файлы теперь открывать в FDT ? Если открывать как BIN, то там по прежнему всё в куче.

Проверил , действительно каша в таком варианте сохранения не разбирается даже FDT. Пересохранил. файлы в ЛС отправил. Я так понимаю FDT отдельные файлы разделов памяти записать также не сможет, без правки...

Теперь всё стало понятно. FDT каким-то образом наложил Data на начало User - байты в User были заменены байтами Data.